La humedad que brinda el bosque de niebla es vital para las ranas, sapos y salamandras. Estos animales de piel húmeda y desnuda son llamados anfibios. Por otra parte, en sitios donde penetran los rayos del sol, las lagartijas y serpientes se asoman a tomar calor. Estos animales pertenecen al grupo de los reptiles y tienen la piel escamosa y seca.

Anfibios y reptiles son los habitantes más amenazados del bosque de niebla, ya que sus hábitats y áreas de reproducción son muy vulnerables a perturbaciones como la contaminación del agua y el aire, el uso de insecticidas y la destrucción de la vegetación.

Los anfibios y reptiles son alimento de aves, mamíferos e incluso de insectos y arañas, aunque también se alimentan de insectos transmisores de enfermedades y de pequeños vertebrados. Algunos se alimentan de diversos frutos y ayudan a la dispersión de las semillas.